Las principales funciones de los linfocitos T consisten en: la defensa frente a microorganismos intracelulares, y la activación de otras células como macrófagos y linfocitos B. Los linfocitos T son capaces de interactuar con otras células porque sus receptores antigénicos solo pueden reconocer antígenos que se presentan en otras células.
Estos auto-AC se pueden encontrar en distintos tipos de enfermedades hepáticas autoinmunes. La presencia de estos AC son de gran ayuda para el diagnóstico de estas enfermedades, sin embargo su rol en la patogenia no está muy clara. El sustrato que se utiliza para su detección mediante IFI corresponde a cortes congelados de riñón y estómago de ratón o rata.
Los AC anti-citoplasma de neutrófilos fueron detectados por primera vez en 1982, asociados a glomerulonefritis y enfermedades sistémicas. Los ANCA son anticuerpos contra los gránulos primarios y secundarios del citoplasma de los neutrófilos y de los lisosomas de los monocitos. Suelen demostrarse mediante IFI sobre neutrófilos fijados con etanol, pero también pueden detectarse los antígenos específicos asociados a los distintos patrones (con inmunoensayos como el ELISA), aumentando así la especificidad de los resultados.
Los ANA comprenden una variedad de auto-anticuerpos (AC) contra distintos constituyentes del núcleo de la célula, como son el ácido desóxirribonucleico (ADN), el ácido ribonucleico (ARN) y otras proteínas nucleares. Con esta técnica también es posible visualizar auto-AC dirigidos contra antígenos citoplasmáticos.
Los anticuerpos extraíbles del núcleo (ENA) se dirigen contra antígenos nucleares no histonas. Comprenden 6 tipos distintos: anti Sm, anti RNP, anti Ro/SSA, anti La/SSB, anti Scl 70 y anti Jo1.
Los anticuerpos anti DNA se describieron por primera vez a fines de la década de 1950. Los anticuerpos anti DNA se pueden dividir en dos grupos principales: los que reaccionan con el DNA monocatenario o desnaturalizado (simple hebra), y aquellos que reaccionan con el DNA nativo o bicatenario (doble hebra). Los anticuerpos anti DNA doble hebra (ds) están presentes en el 50 a 70% de los pacientes con LES.